【摘 要】目的：对医院学科建设各层级指标体系权重进行优化。方法：按层次分析法的步骤，设计判断矩阵问卷并请临床学科带头人、科研处、教务处、医务处等职能处室、基层医务人员填报数据，对数据进行归一化处理及一致性判断，获得各层级指标权重。结果：咨询专家工作10年以上占85.7%，高级职称占72.4%，硕士及以上学历占95.2%。医院学科建设评价指标体系中，一级指标权重最高的是医疗品牌（0.3286），最低的是社会声誉（0.1017） ；二级指标权重最高的是医疗水平（0.1340），最低的是人才梯队（0.0310）；三级指标权重最高的是危重/疑难患者、三四级手术比例、CMI值（0.0502），最低的是SCI收录期刊编委及国内合法期刊副主编以上（0.0059）；部分三级指标下属的四级指标权重最高的是国家级领军人才（0.0353），最低的是中国科技核心期刊（统计源）论文影响力（0.0033）。结论：基于层次分析法的指标体系权重分配科学且合理，部分指标权重与采用焦点小组方法赋分的结果一致，部分指标权重反映了教育部、科技部出台的相关政策，医院学科建设指标体系还需要随着国家、行业政策，单位发展规划以及运行实践不断调整优化。